请注意，以上缴费方法可能存在一定的变化，请以南京市社保局的官方通知或网站公告为准。
南京市灵活就业人员社保缴费方法有以下几种途径：
1. 在线缴费：南京市社保局的官方网站可以提供在线缴费功能，灵活就业人员可以登录网站，选择缴费项目并填写相关信息，然后通过网上银行或支付宝等方式缴纳社保费。
2. 手机APP缴费：南京市社保局也推出了手机APP，可以通过手机APP登录账户，选择缴费项目并填写相关信息，然后通过手机支付功能缴纳社保费。
3. 银行柜台缴费：灵活就业人员可以选择去银行柜台缴纳社保费，需要携带相关的证件和缴费金额，填写相应的缴费单据并进行缴费。
4. 社保代办机构缴费：南京市设有一些社保代办机构，灵活就业人员可以选择委托代办机构为其进行社保缴费，需要提供相关的个人信息和缴费金额。
请注意，以上缴费方法可能存在一定的变化，请以南京市社保局的官方通知或网站公告为准。