南京灵活就业人员停保的方式和补缴程序如下：1.停保：南京灵活就业人员停保有两种情况：a.暂时停保：自愿申请暂时停保的情况下，可前往所在社区或属地的社会保险经办机构办理停保手续。停保期限一般不超过6个月。
南京灵活就业人员停保的方式和补缴程序如下：
1. 停保：南京灵活就业人员停保有两种情况：
a. 暂时停保：自愿申请暂时停保的情况下，可前往所在社区或属地的社会保险经办机构办理停保手续。停保期限一般不超过6个月。
b. 长期停保：长期停保是指超过6个月以上中断缴纳医疗保险费的情况。长期停保需要重新办理参保手续。可前往所在社区或属地的社会保险经办机构办理参保手续。
2. 补缴：南京灵活就业人员中断医保缴费后，如需恢复参保，需要补缴中断期间的医疗保险费。
a. 补缴时间：中断期满后的一个月内，可前往所在社区或属地的社会保险经办机构补缴医疗保险费。
b. 补缴方式：一般可以通过现金、刷卡或银行转账等方式进行补缴。
c. 补缴费用计算：补缴金额一般是根据中断期间每个月的缴费标准计算，具体金额可向社会保险经办机构咨询。
请注意，在办理停保和补缴手续前，建议与所在社区或属地的社会保险经办机构联系，了解具体办理流程和所需材料，以确保顺利完成相关手续。