灭活疫苗则是通过在实验室中孵育和培养大量新冠病毒，再将其经过适当处理使其失去活性，得到灭活病毒后制备疫苗。而灭活疫苗虽然经过处理失去活性，但其制备过程涉及到活病毒，可能会存在安全风险，需要进行严格的病毒灭活控制和质量控制。两种疫苗在安全性上略有差异，但都有望提供保护性免疫反应。
温州重组蛋白新冠疫苗和灭活疫苗在工作原理和制备方法上存在一些区别。
1. 工作原理：温州重组蛋白新冠疫苗利用基因工程技术将新冠病毒的S蛋白基因导入其他细胞，使其能够产生具有新冠病毒S蛋白特征结构的蛋白质，从而引起人体免疫系统的反应，增强免疫力。而灭活疫苗则是通过在实验室中将新冠病毒培养经过适当处理，使其丧失活性但仍能激发人体免疫系统产生保护性免疫反应。
2. 制备方法：温州重组蛋白新冠疫苗通过基因工程技术，将新冠病毒的S蛋白基因导入其他细胞，利用细胞进行表达和提取活性的S蛋白，然后再制备疫苗。灭活疫苗则是通过在实验室中孵育和培养大量新冠病毒，再将其经过适当处理使其失去活性，得到灭活病毒后制备疫苗。
3. 安全性：温州重组蛋白新冠疫苗不包含活病毒，因此它的安全性相对较高，不会导致感染和进一步疾病传播。而灭活疫苗虽然经过处理失去活性，但其制备过程涉及到活病毒，可能会存在安全风险，需要进行严格的病毒灭活控制和质量控制。
总的来说，温州重组蛋白新冠疫苗是通过基因工程技术制备的，而灭活疫苗是通过将新冠病毒失去活性后制备的。两种疫苗在安全性上略有差异，但都有望提供保护性免疫反应。具体使用哪种疫苗，需要根据各地的疫情和相关专家的推荐来确定。